HAM dan Demokrasi
Program ini bertujuan untuk melakukan penguatan dan advokasi (pembelaan) HAM, terutama bagi kelompok marginal di pedesaan dan perkotaan. Upaya penguatan HAM dilakukan dengan melakukan pendidikan/ pelatihan HAM baik kepada aktivis NGO atau masyarakat basis. Sedangkan Advokasi yang dilakukan adalah dengan melakukan studi kebijakan pemerintah yang akan diberlakukan, baik melalui seminar, penelitian, diskusi. Selanjutnya yang merupakan implementasi advokasi paling utama adalah monitoring dan pelaporan pelanggaran HAM.
Gender dan Perempuan
Program ini merupakan upaya meniadakan atau mengurangi sebuah perilaku atau kebijakan yang bisa gender, atau diskriminatif terhadap gender. Serta mendorong tumbuh dan berkembangnya kesadaran dan kesetaraan gender. Guna mencapai tujuan tersebut maka kegiatan yang hendak dikembangkan LAKPESDAM Jombang adalah: Pelatihan-pelatihan gender, Pelatihan hak-hak perempuan, Pelatihan hak-hak reproduksi, Kampanye anti kekerasan terhadap perempuan dll.
Local Good Governance
Program ini bertujuan untuk mendorong keterlibatan rakyat dalam proses penyelenggaraan pemerintahan serta mendorong berkembangnya nilai-nilai good governance pada institusi Pemerintahan Daerah, civil society dan Sektor Swasta.
Kegiatan yang dilakukan diantaranya adalah: Pelatihan advokasi kebijakan, Pelatihan Leadership for Good Governance, Penguatan Peran Serta CSO dan Sektor Swasta dalam Penyelenggaraan Pemerintahan Kabupaten/Kota di Jawa Timur, Workshop Pengembangan Net Working antar Daerah, Gerakan Kampanye dan Penerbitan buletin.
Tranformasi Agama/ Budaya
Program ini bertujuan untuk menemukan pola strategis dalam melakukan penguatan civil society. Kegiatan kajian-kajian yang dilakukan adalah: Diskusi bulanan yang diadakan di kantor LAKPESDAM Jombang, memfasilitasi seminar-seminar dalam upaya mencari pola baru upaya penguatan civil society atau kegiatan ini bertujuan untuk mengembangkan peran–peran kelompok strategis keagamaan melalui kajian kritis tafsir teks-teks otoritatif keagamaan yang diduga bias budaya dan paradigma. Kesemuanya akan dikembalikan pada nila-nilai islam, yakni Islam sebagai rahmat bagi semesta dengan memperhatikan persoalan-persoalan kekinian dan keindonesiaan.
Akses Ekonomi Basis
Program ini bertujuan untuk mengembangkan peningkatan kesejahteraan basis sekaligus sebagai tidak lanjut dari kegiatan advokasi politik basis terhadap kelompok kepentingan lain, program ini dilakukan untuk merespon kebutuhan riil masyarakat dalam jangka pendek untuk kesehatan dan pemenuhan kebutuhan pokok dasar maupun dalam jangka panjang peningkatan kesejahtreaan basis yang secara otomatis akses terhadap kepentingan-kepentingan lain akan terakomodir misal: pendidikan anak-anak, permukiman layak tinggal, pemenuhan gizi keluarga.
